我國海關監管特殊區域共有11種，具體為：1、保稅區；2 、出口加工區；3、保稅物流園區；4、保稅港區；5、綜合保稅區；6、出口監管倉庫；7、進口保稅倉庫；
8、保稅物流中心（A）型；9、保稅物流中心（Ｂ）型；10、珠海跨境工業園區； 11、霍爾果斯邊境合作區。
保稅區亦稱保稅倉庫區：稅區具有進出口加工、國際貿易、保稅倉儲商品展示等功能，享有“免證、免稅、保稅”政策,實行“境內關外”運作方式，是中國對外開放程度最高、運作機制最便捷、政策最優惠的經濟區域之一。
我國在1990年5月，在上海外高橋建立中國第一個保稅區，又相繼建設了天津港、大連、深圳的福田和沙頭角、寧波、廣州、張家港、海口、廈門、福州、青島、汕頭、珠海、海南洋浦等保稅區。
保稅區的審批權限由國務院進行審批。
保稅區的主要功能：出口加工、進口保稅倉儲、國際貿易、商品展示。
保稅區的主要政策：進口區內自用物資免稅，其他進口貨物保稅。
海關監管特點：設有專門管理機構，進口貨物二線管理，出口貨物一線管理。
(1)外貿企業 對保稅區外企業運到保稅區（不包括保稅物流園區、保稅倉庫以及出口監管倉庫）的貨物按規定征收增值稅，不予辦理退（免）稅。 對保稅區內企業從區外購進貨物，將這部分貨物購進或加工后出口，可按規定辦理退（免）稅。
(2)生產企業 對保稅區外的生產企業運到保稅區（不包括保稅物流園區、保稅倉庫以及出口監管倉庫）的貨物按規定征收增值稅，不予辦理退（免）稅。 保稅區內生產企業從區外有進出口經營權的企業購進原材料、零部件等加工成產品出口的，可按保稅區海關出具的出境備案清單以及其他規定的憑證，向稅務機關申請辦理免、抵、退稅。
保稅區內進料加工企業從境外進口料件，可憑保稅區海關簽發的“海關保稅區進境貨物備案清單”辦理《生產企業進料加工貿易免稅證明》等單證。
出口加工區發展規劃
出口加工區是指一國或地區在港口、機場附近等交通便利的地方劃出的一定區域，在區內搞好水、電、道路、通訊、廠房等基礎設施，用優惠辦法吸引外國投資，發展在國際市場上有競爭能力的出口加工工業，以達到利用外資、引進技術、增加就業、賺取外匯等目的。
出口加工區是海關監管的特殊封閉區域.面積3平方公里以內.其功能僅限于產品外銷的加工貿易，區內可設置出口加工企業及其相關倉儲，運輸企業。出口加工區將實行封閉式的區域管理模式，在管理手段等方面較之傳統的監管模式具有較大的優越性，海關在實行24小時監管的同時，將簡化現行手續，為規范的出口加工企業提供更寬松的經營環境和更快捷的通關便利，實現出口加工貨物在主管海關“一次申報，一次審單，一次查驗”的通關要求，逐步滿足現代跨國型企業“零庫存生產”的需要。出口加工區審批權限是由國務院進行審批。
出口加工區的主要功能：加工出口貨物，另從2007年起，7個經拓展保稅物流功能的試點。
主要稅收政策：進口稅收政策同保稅區，國內入區貨物退稅，區內交易不征增值稅、消費稅。
海關監管特點：設有專門管理機構，進出口貨物一線放開二線管理，即進境貨物出具清單，進出口報關單在二線出具，但統計按進出境口徑掌握。 備注：除黑龍江、山西、貴州、青海、寧夏、甘肅、西藏外，其他地區都有。
運往出口加工區貨物退（免）稅政策規定：
(1)、區外企業銷售給區內企業并運入出口加工區、保稅物流園區供區內企業使用的國產設備、原材料、零部件、元器件、包裝物料，以及建造基礎設施、加工企業和行政管理部門生產、辦公用房的基建物資（不包括水、電、氣）。
(2)、區外企業銷售給出口加工區內企業不允許辦理退（免）稅的貨物。
a.區外企業銷售給區內企業、行政管理部門并運入出口加工區供其使用的生活消費品、交通運輸工具。
b.區外企業銷售給區內企業、行政管理部門并運入出口加工區供其使用的進口機器、設備、原材料、零部件、元器件、包裝物料和基建物資。
c.區內企業委托區外企業生產加工的產品。
(3)、對出口加工區運往外區的貨物，海關按照對進口貨物的有關規定辦理進口報關手續，并對報關的貨物征收增值稅、消費稅。
(4)、對于出口加工區內的生產企業生產出口貨物所耗用的水、電、氣、實行退稅政策，準予退還所含的增值稅。
保稅港區發展規劃
保稅港區是指經國務院批準，設立在國家對外開放的口岸港區和與之相連的特定區域內，具有口岸、物流、加工等功能的海關特殊監管區域。保稅港區的審批權限在國務院。
保稅港區的主要功能：倉儲物流，對外貿易，國際采購、分銷和配送，國際中轉，檢測和售后服務維修，商品展示，研發、加工、制造，港口作業等9項功能。
保稅港區主要的政策：享受保稅區、出口加工區、保稅物流園區、港區的政策。主要稅收政策可概括為：境外貨物入港區保稅；國內貨物入港區視同出口，實行退稅；港區內企業之間的貨物交易不征收增值稅和消費稅。
海關監管特點：設有專門管理機構，進出口貨物一線放開二線管理，即進境貨物出具清單，進出口報關單在二線出具，但統計按進出境口徑掌握。
保稅港區出口退（免）稅政策; 境外貨物入港區保稅；國內貨物入港區視同出口，實行退稅；港區內企業之間的貨物交易不征收增值稅和消費稅。
備注：已經批準的保稅港區有上海、天津、大連、海南等。
綜合保稅區發展規劃
綜合保稅區是整合現有出口加工區、保稅物流中心和口岸功能的特殊區域。綜合保稅區的審批權限在國務院。
綜合保稅區的功能：是一個集保稅加工、保稅物流、進出口貿易、采購分銷、金融服務、檢測維修、展示展覽等功能于一體的特殊監管區域。稅收、外匯政策參照洋山保稅港區，海關比照保稅港區的監管辦法對其實施監管。
綜合保稅區的主要政策：綜合保稅區是目前中國內地開放層次最高、優惠政策最多、功能最齊全的特殊功能區。它整合了海關特殊監管區域的所有功能政策，如國外貨物入區實行保稅，國內貨物入區視同出口、實行退稅。企業在區內不僅可以進行貨物的保稅倉儲和加工、制造業務，還將可以開展對外貿易等業務，將有力推動中國加工貿易轉型升級。
海關監管特點：設有專門管理機構，進出口貨物一線放開二線管理，即進境貨物出具清單，進出口報關單在二線出具，但統計按進出境口徑掌握。
綜合保稅區申報、審批和驗收前詳細流程下載地址：
保稅物流園區發展規劃
1、保稅物流園區是為發揮保稅區的政策優勢和港區的地理優勢，而設立的由海關事實監管的特殊封閉區域。保稅物流園區的審批權限是由國務院進行審批。
2、保稅物流園區的功能：主要以物流倉儲及簡單加工為主。
3、保稅物流園區的主要政策：稅收政策同保稅區，國內入區貨
物退稅，區內交易不征增值稅、消費稅。
4、保稅物流園區的海關監管特點：設有專門管理機構，進出口貨物一線放開二線管理，即進境貨物出具清單，進出口報關單在二線出具，但統計按進出境口徑掌握。
5、銷售給保稅物流園區企業貨物退（免）稅規定
對保稅物流園區外企業運入物流園區的貨物視同出口，區外企業憑海關簽發的出口貨報關單（出口退稅專用）及其它規定憑證向主管出口退稅的稅務機關申報辦理退（免）稅。
出口監管倉庫
1、監管倉庫是對已辦結海關出口手續的貨物進行存儲、保稅物流配送、提供流通性增值服務的海關專用監管倉庫。出口監管倉庫的審批權限在海關總署。
2、監管倉庫的主要功能：是配送出口貨物。
3、監管倉庫的主要政策：試點監管倉享受入倉退稅政策，其他離境之后退稅。
4、出口監管倉庫的監管特點：一般不設專門機構，貨物離境再簽發入倉報關單。存入出口監管倉庫的貨物，視為正式出口貨物。出口貨物存入出口監管倉庫后，貨物所有權屬外商。
5、出口監管倉退稅政策：
（1）對企業從海關出口監管倉提取的料件，不予開具進料加工貿易免稅證明。
（2）通過海關監管倉出口的貨物，可憑海關簽發的出口貨物報關單（出口退稅專用）及其它規定憑證，按現行規定辦理出口貨物退（免）稅。
備注：申請入倉退稅，國家稅務總局也要參與審批。
進口保稅倉庫
1、進口保稅倉庫是指經海關批準設立的專門存放保稅進口貨物及其他未辦結海關手續貨物的倉庫。這種倉庫僅限于存放供來料加工、進料加工復出口的料件，暫時存放之后復運出口的貨物和經過海關批準緩辦納稅手續進境的貨物。我國的保稅倉庫主要有3種類型：
（1）、轉口貿易保稅倉庫。轉口貿易項下的進出口貨物可以免征進出口關稅和其他稅收；如果需要改變包裝、加刷嘜嗎，必須在海關監管下進行。
（2）、加工貿易備料保稅倉庫。來料加工、進料加工項下存入保稅倉庫的免稅進口的備用物料，經過海關核準之后提取加工復出口的，海關將根據實際出口數量征收或者免征原進口物料的關稅。
（3）、寄售維修保稅倉庫。為引進的先進技術設備提供售后服務進口的維修零備件，可以免辦納稅進口手續存入保稅他庫。進口保稅倉庫的審批權在海關總署。
2、稅倉庫的主要功能：進口保稅貨物。
3、保稅倉庫的主要政策：進口保稅。
4、保稅倉庫的海關監管特點：一般不設專門機構。
